El Cuerpo Médico Forense Morgue Judicial de la Provincia de Misiones ha sido creado a partir de la sanción de la ley 3436/08. Antes de la sanción de la respectiva ley, y de la habilitación de la Morgue Judicial se realizaban las autopsias judiciales en el laboratorio de Anatomía Patológica, del Hospital Dr Madariaga, y se utilizaba la Morgue Hospitalaria para el depósito de los cadáveres Judiciales.
El Cuerpo Médico Forense en el año 1998 inaugura la Morgue Judicial, en un predio cedido al Poder Judicial en carácter de préstamo por Salud Pública de la pcia sito Av. Quaranta S/N Ruta Nac 12 donde funciona el Hospital Baliña No se contaba con laboratorios para pericias bioquímicas/toxicológicas/patológicas, todas estas ramas auxiliares se realizaban a través de convenios con entes de la policía de Misiones.
Constitución del CMF de la Pcia de Misiones, en sus inicios - Acuerdo Extraordinario N° 3 de fecha 02/07/98:
- Se designa por Unanimidad los cargos de JEFE Y SUBJEFE
- Se designa por Unanimidad a Médicos de Tribunales: un cargo para Puerto Rico, un cargo para Oberá y un cargo para Posadas
- Se nombra por mayoría un cargo de Bioquímico.
- Se nombra por unanimidad un cargo de Auxiliar Técnico Forense.
Por Acuerdo del STJ N° 13/2000 se aprueba Reglamento para el Funcionamiento del Cuerpo Médico Forense Poder Judicial Misiones y en anexo Reglamentación para el funcionamiento de la Morge Judicial para uso policial.
En el año 2002 se firma acta complementaria del convenio marco entre el Poder Judicial y la Universidad Nacional de Misiones a través de la Fundación Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales para prestación de servicios y asistencia técnica en estudios moleculares de ADN.